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科学家使用Affymetrix定制微阵列推进疟疾研究

发布时间:2019-03-12 14:06:34

科学家使用Affymetrix定制微阵列推进疟疾研究 2010年10月25日 Affymetrix公司(纳斯达克股票代码:AFFX)今天宣布,由波士顿学院,Broad研究所和伦敦帝国理工学院的科学家领导的国际研究

  科学家使用Affymetrix定制微阵列推进疟疾研究

  2010年10月25日

  Affymetrix公司(纳斯达克股票代码:AFFX)今天宣布,由波士顿学院,Broad研究所和伦敦帝国理工学院的科学家领导的国际研究团队使用Affymetrix定制微阵列通过评估遗传结构的变异来推进疟疾研究。检测疟疾媒介蚊子种群的已知和新的遗传差异。该研究将使蚊子基因与杀虫剂抗性和寄生虫感染易感性相关联的关联研究成为可能,最终有助于减少疟疾传播。 “我们计划向社区提供这个功能强大的阵列”今天发表在“科学”杂志上,这个由17位科学家组成的全球财团的突破性发现,将有助于进一步研究有效的疟疾干预措施,每年使超过2.4亿人感染疟疾。导致86万人死亡,其中大多数是年幼儿童。虽然杀虫剂和抗疟疾药物的进展降低了传播和死亡率,但由于对干预措施的抵抗力增强,蚊子的适应性以及病原体逃避防蚊的能力,降低的速度有可能减缓。 “2007年盖茨基金会梅琳达盖茨倡导的疟疾研究人员重新实现的目标是在我们的一生中根除疟疾,”波士顿学院DeLuca生物学教授,首席研究员Marc Muskavitch说。 “但疫苗并未取得成功,杀虫剂和抗疟疾药物仍然失效。

   如果我们要根除它,就需要新的干预措施,“他加了。 “我们需要的是一个更好的工具来查看蚊子种群的复杂性,帮助我们找到帮助蚊子逃避干预和传播疾病的基因。”该团队使用Anopheles冈比亚(AG)SNP1阵列,这是由Affymetrix与研究团队合作设计的专有微阵列。该阵列具有在冈比亚按蚊的四个测序菌株中发现的300万个中的400,000个SNP,提供比疟疾载体生物学家可获得的42和1,536标记组高得多的分辨率。在几个疟疾季节,国际财团,包括圣母大学,马里疟疾研究和培训中心以及哈佛公共卫生学院的科学家,从马里和布基纳法索收集了蚊子样本,并使用Affymetrix平台进行基因分型。用于验证阵列探针的样品,并为该疟疾载体蚊子定义了一个大大扩展的SNP标记组。 “我们的分辨率比以往任何时候都高,我们开始了解疟疾病毒如何在一个称为”初期物种形成“的过程中繁殖分离,并发展出不同的特征,以便更好地避免我们针对它们部署的干预措施。”马斯卡维奇说。 “现在我们正在开发新的合作伙伴,使用这个工具来了解对杀虫剂具有抗性的基因和蚊子传播疟疾的能力。了解这些基因可以帮助我们更有效地控制蚊子种群,并试图帮助蚊子更有效地利用其防御来减少疟疾寄生虫传播。“相关故事研究发现患有ASD的儿童更容易受到虐待,研究发现共同发生ADHD的自闭症儿童具有更大的适应性行为障碍研究揭示了抗生素抗性基因如何在细菌之间转移“这项开创性研究使疟疾社区的科学家更接近于识别与疟疾传播,杀虫剂抗性和寄生虫易感性有关的蚊子基因和等位基因, Affymetrix总裁兼首席执行官Kevin King表示。 “由于他们的工作,大大减少这种疾病传播和改善全球数百万人生活的前景是可以实现的。”科学家计划鼓励在载体生物学界采用AG SNP1阵列,为下一波研究做准备,这将集中于更深入地了解蚊子种群的复杂性,影响疟原虫传播的蚊子基因,以及可用于改善蚊子控制的基因。 “我们计划为社区提供这个强大的阵列,”穆斯卡维奇说。 “我们希望在明年年初完成这项工作,届时Affymetrix将提供这项工作。”作为我们持续关注在各种物种和疾病及传染病领域进行基因组研究的一部分,我们是很高兴与波士顿学院的Muskavitch博士,Broad研究所的Roger Wiegand以及他们的整个团队合作,为科学界广泛提供这种有价值的研究工具,“DNA应用战略营销副总裁Jay Kaufman说道,在Affymetrix。“凭借我们在这些合作伙伴关系方面的悠久历史,我们认识到尖端科学研究与经过验证的微阵列技术相结合的价值,以及这为追求改善人类健康的人带来的整体效益。”另一个Affymetrix定制阵列帮助科学家们寻求开发更有效的治疗疟疾的方法.GNF疟疾平铺阵列是一种恶性疟原虫的高密度平铺阵列与诺华研究基金会基因组学研究所合作,一个国际科学家小组使用这一研究来回应对新一类抗疟疾药物的耐受性增加。在斯克里普斯研究所细胞生物学系的基因组科学家Elizabeth Winzeler的带领下,该团队使用该阵列筛选了一种新的寄生虫杀灭化合物的多种化学库,并发现了一种寄生虫基因,可介导对新的潜在药物导致的抗性。 “Affymetrix微阵列技术使我们能够快速检查抗性疟疾寄生虫菌株的整个基因组,并发现PfATP4中可能参与维持离子稳态的新进化突变,”温泽勒说。 “微阵列允许我们同时识别PfATP4中的单碱基变化和拷贝数变异。目前尚不清楚,如果我们使用全基因组测序,我们就会取得成功。“资料来源:Affymetrix,Inc。